Molly Mahoney är den något udda och osäkra chefen för Mr Magorium’s Wonder Emporium, den mest fantastiska, annorlunda och underbara leksakaffären i världen. Mr Magorium bestämmer sig vid 243 års ålder att lämna över affären i Mollys vårdnad, samtidigt som en ny revisor börjar. Han förstår inte alls den otroliga affären och dess magi, så Molly och resten av personalen går ihop och protesterar tillsammans mot den nya revisorn genom att sätta stopp för all magi i affären tills han förstår hur underbar och märkvärdig butiken verkligen är.